سازمان ها، موسسات آموزشی و پژوهشی ، دانشگاه ها و مراکز علمی برای مجازی سازی آموزش های خود و یا استقرار دانشگاه مجازی با چالش های بسیاری روبرو هستند. این چالش در چند وجه نیازمند انتخاب و تصمیم گیری های مدیریتی است.

این چالش ها و مواردی است که نیازمند بررسی، ارزیابی و مشاوره است :

• انطباق امکانات و تکنولوژی های سامانه ها و نرم افزارهای تابع آن با نیازمندی های، قوانین و روال های آموزشی و اداری
• پوشش حداکثری تغییر و تحول های آموزشی و تکنولوژی های کاربران
• توسعه پذیری امکانات و توان حداکثری ارتباطات با سامانه های مختلف برای ارائه یا دریافت سرویس ها
• ارائه سطوح مختلف گزارشات، ارزیابی های آموزشی، مدیریت ظرفیت های مختلف سرویس دهی